V svojem znanstvenem delu raziskuje predvsem zgodovino in kulturo Balkana, nacionalno identiteto, kulturno dediščino ter kolektivni spomin. Posebno pozornost namenja tudi političnim in družbenim predstavam o drugih narodih ter oblikovanju zgodovinskih stereotipov. Med njegova pomembnejša dela sodijo Divja Evropa, Goli otok – Titov gulag in Nacionalizacija preteklosti. Za svoje znanstveno delo je prejel več priznanj, med drugim Murkovo priznanje Slovenskega etnološkega društva.