Svojo prvo razpravo Domobranstvo na Primorskem v boju proti narodnoosvobodilnemu gibanju je objavil v zborniku Osvoboditev Slovenije 1945 (1977), s podobno tematiko je sledilo še nekaj razprav kot Domobranstvo v Ljubljani in ustanovitev SNVZ na Primorskem (1978), Domobranstvo na Primorskem (1979), Domobranstvo na Tolminskem (1979), Propaganda nasprotnikov narodnoosvobodilnega boja na Primorskem (1980), kot vrh teh objav se kaže Mlakarjeva knjiga Domobranstvo na Primorskem 1943–1945 (1982), ki je prejela tudi Kajuhovo nagrado (1981).
V splošne probleme slovenske kontrarevolucije pa je posegel z razpravami: General Rupnik in slovensko domobranstvo (1981), O političnih programih slovenske kontrarevolucije 1941–1945 (1982) ter Elemente des Faschismus in einigen politischen Bewegungen in Slowenien 1918–1945 (Elementi fašizma v nekaterih političnih gibanjih na Slovenskem 1918–1945, 1982). Mlakar se je s predavanji udeležil več srečanj zgodovinarjev, več manjših prispevkov in ocen je objavil v dnevnem in strokovnem tisku. Več o avtorju na: https://ojs.inz.si/pnz/article/view/227/372