Maja Milčinski je diplomirala na Filozofski fakulteti v Ljubljani iz sociologije, etnologije in filozofije. Leta 1982 je na oddelku za filozofijo vpisala podiplomski študij iz zgodovine filozofije – kitajske filozofije, ki ga je tri leta kasneje zaključila z magistrskim delom Lunyu z vidika kitajske sedanjosti. Naslednja štiri leta je študirala v LR-Kitajski, kjer je na Univerzi v Nanjingu končala specializacijo iz klasične in moderne kitajščine in književnosti, l. 1984 iz zgodovine kitajske filozofije na Univerzi v Pekingu in l. 1986 iz zgodovine kitajskih religij in filozofije na Inštitutu za proučevanje svetovnih religij – Akademija za družbene vede v Pekingu. Po končanem študiju v LR-Kitajski se je marca 1986 zaposlila v Centru za proučevanje sodelovanja z deželami v razvoju v Ljubljani, na oddelku za sinologijo.

V študijskem letu 1989/1990 je bila gostujoča znanstvenica na Univerzi v Tokiu,  kjer je s temo Wabi-Sabi v odnosu do budizma, konfucijanstva in daoizma odprla novo področje proučevanja japonske filozofije in religij. Januarja 1991 je promovirala iz filozofije na Filozofski fakulteti v Ljubljani z disertacijo Pojem praznine pri daoističnih filozofih in v zenu. Leta 1993 je bila izvoljena v naziv izredne gostujoče profesorice za filozofije in religije Azije v International Research Center for Japanese Studies v Kjotu, kjer je v japonščini predavala o religijah in filozofijah Azije, predavala je tudi na univerzi v Tokiu. 

Kot mlada raziskovalka je na oddelku za filozofijo Filozofske fakultete v Ljubljani prevzela vse obveznosti pri uvajanju in izvajanju novega predmeta in raziskovalnega področja Filozofije Orienta (kasneje je bilo predmetno področje zaradi zastarelosti naziva preimenovano v Azijske filozofije). S predavanji je sodelovala tudi na oddelku za zgodovino Filozofske fakultete v Ljubljani, predavala na teoloških fakultetah v Ljubljani in Mariboru, na FDV itd.  Predava tudi drugod posvetu, v Indiji, na Nizozemskem, v Angliji, Novi Zelandiji, ZDA, Španiji, Kanadi  itd. 

Prevodi klasičnih kitajskih filozofskih del v slovenščino: 

• Lao Zi: Dao de jing (2009)
• Lao Zi: O praznini (2006)
• Zuang Zi: Klasik Dežele južne rože (2004)
• Klasiki konfucijanstva – Štiri knjige: Konfucij, Mencij, Nauk o sredini, Veliki nauk (2005)
• Yijing – Knjiga premen (1992)

Prevodi indijske filozofije v slovenščino:

• Swami Vivekananda Radža joga (2000)
• Rammurti S. Mishra: Filozofija in psihologija joge (2001)

Samostojne knjige:

• Strategije osvobajanja (2006)
• Japonska in Kitajska med religijo in filozofijo (1995)
• Mali slovar azijskih filozofij (2003)