Husserl se je rodil v Prossnitzu na Češkem v judovsko družino, vendar pa se je kasneje skupaj z ženo spreobrnil v protestantizem. Od leta 1878 do leta 1881 je Husserl nadaljeval študij matematike, fizike in filozofije v Berlinu. Doktorat s področja matematike je naredil na Dunaju, vendar pa se je takoj za tem vrnil v Berlin, kjer je postal asistent. Nato je odšel na Dunaj, kjer se je učil pod Francozom Brentanom, na pobudo Masaryka, kasnejšega predsednika. Bernatova predavanja so na Husserla dolgotrajno vplivala.
Leta 1900 in 1901 je izšlo njegovo prvo fenomenološko delo Logična raziskovanja v dveh delih. V prvem desetletju dvajsetega stoletja je Husserl močno predelal in prečistil njegovo metodo v transcendentalno fenomenologijo. Temu je sledilo tudi njegovo drugo delo Ideje.
Leta 1916 je Husserl postal profesor v Freiburgu. Leta 1922 je imel štiri predavanja o fenomenologiji in njeni metodi v Londonu, leta 1923 pa je zavrnil klic v Berlin. Upokojil se je leta 1928. Predaval je tudi v Parizu. Leta 1933 je Hitler prevzel Nemčijo, posledično pa je Husserl zaradi judovskih korenin zgubil veliko ugleda. Leta 1935 je imel še zadnjo večjo serijo predavanj v Pragi. Umrl je Freiburgu.